Мультсериал основан на одноименной серии комиксов, повествующих о еще молодом Человеке-пауке, которому Ник Фьюри предложил пройти тренировочный курс для улучшения собственных навыков. В ходе обучения Человек-паук обзаводится командой из Люка Кейджа, Железного кулака, Новы и Белой тигрицы. В ходе тренировок ему предоставляется собственный мотоцикл (Спайдерцикл). В одной из серий Человек-паук встретит Железного Человека, который сделает ему броню Железного Паука.
После укуса генетически модифицированного паука Питер Паркер пытается контролировать полученные суперспособности и бороться с преступностью в качестве супергероя - Человека-Паука.